国土交通省は大雨に伴う5日正午までの被害状況をまとめ、9県の45河川で氾濫が起きたと発表した。土砂災害も6県で計14件発生。各地の鉄道施設に被害が出たほか、国が管理する新潟県村上市の国道113号では道路が流されて通行止めになるなど、被害は広い範囲に拡大した。